重庆工商大学应用物理系的前身是原渝州大学物理系，1981年开始招收专科学生，2001年设置物理学本科专业，2004年新增应用物理学本科专业，目前拥有一支理论基础扎实且创新能力突出、以中青年教师为主的教学团队,其中教授4人，副教授7人，讲师4人，共计15人，具有博士学位6名，在读博士2名。他们中既有致力于相对论天体物理、光子晶体和声子晶体等前沿领域研究的专家学者，也有在各自研究领域异军突起且发展潜力巨大的青年博士。新世纪以来，应用物理系教师主持了国家自然科学基金、重庆市基础与前沿研究计划项目、重庆市教委科学技术研究项目等省部级以上科研项目20余项，主持了教育部高等学校物理学类专业教学指导委员会教研项目、重庆市教委教育教学改革项目、重庆市教育科学规划课题等省部级以上教育教学改革研究项目10余项；荣获重庆市科学技术奖（自然科学三等奖）1项，重庆市教学成果三等奖1项，其它省部级教学成果奖3项；发表SCI、EI检索的学术论文150余篇；发表教育教学改革论文60余篇；出版学术专著、教材5部。

本专业主要培养物理学和光电子技术、人工智能及其他非线性、复杂性学科交叉领域从事科研、教学、技术开发与应用、管理等工作的高级专门人才。在掌握物理学基本理论与方法，具有扎实数学基础和基本实验技能，兼备光电子技术及复杂性学科等应用学科基础知识、方法和技术前提下，培养学生进行专业技能拓展和在工程学科领域从事工作的能力，培养学生将所学知识和审视问题的方法应用到金融市场等社会交叉学科领域的能力，并可以应用物理学理论和分析处理问题的方法对金融市场建模或实证分析，从而获得模式挖掘、趋势预测和资产定价等的建模分析能力。学生毕业后将具备在电子、材料、能源等战略性高新技术产业领域就业的能力；也具备将本专业的基础和理论应用到诸如金融市场或其他社会科学领域从事技术或管理工作的能力；作为本专业优良传统之一，较大比例的学生将升入国内外知名高校或科研院所继续物理学或交叉学科研究生阶段的学习深造。截止目前，本专业已为地方经济社会发展培养并输送了1000余合格的本科毕业生，他们中有“双一流”高校博士生导师，美国加州大学伯克利分校联合培养的博士研究生，知名企业高管和技术骨干，还有自主创业成绩卓著者。